Ученые СПбГУ создали алгоритм, который ускорит поиск новых антибиотиков

Ученые Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ совместно с коллегой из Университета Карнеги — Меллон (США) создали алгоритм ускоренного поиска потенциальных антибиотиков. Об этом сообщается на сайте СПбГУ. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Microbiology.

Программа нашла более тысячи вариаций известных антибиотиков в каталоге химических структур.

«Появление нового антибиотика на рынке состоит из двух стадий: поиск биологически активного природного вещества, которое войдет в основу лекарства, а затем апробирование эффективности готового препарата на животных и людях. Второй этап ускорить невозможно — это приведет к губительным последствиям, а первый — вполне», — объяснил соавтор разработки Алексей Гуревич.

Ученые из лабораторий разных стран мира собрали крупнейшую базу природных соединений — в ней уже более миллиарда масс-спектров (физических замеров). Она расположена на платформе GNPS (The Global Natural Product Social Molecular Networking), так же как и алгоритм VarQuest, которым теперь могут свободно пользоваться все зарегистрированные исследователи.

Кризис антибиотиков — глобальная угроза: недавно мы рассказывали о химике из Нью-Йорка, который ищет новые лекарства в грязи. Он убежден, что это практически неисчерпаемый источник неоткрытых антибиотиков: в грязи содержится «биологическое оружие», которое одни бактерии применяют против других.