Вероятно, скоро лечить пациентов со сложными инфекциями станет легче. Исследователи из СПбГУ создали инструмент для обработки результатов анализа геномов микроорганизмов в биоматериалах. Разработка уникальна тем, что учитывает особенности российского микробиома.
Прежде чем начать лечение человека, зараженного инфекцией, врачам нужно провести анализ его бактериального флоры. Иногда один ПЦР-тест не помогает — тогда медики используют метод метагеномного секвенирования: анализ микробного сообщества на основе определения выделенной из образца последовательности ДНК.
«Благодаря метагеномному секвенированию можно выявлять бактерии, грибы, археи, паразиты и вирусы, а также оценивать устойчивость микроорганизмов к антибиотикам, уровень их патогенности», — объяснил Павел Сучко, один из разработчиков новой программы.
Программа, созданная петербургскими учеными, быстро обрабатывает загруженные пользователем данные, а затем формирует предварительное заключени — например, сообщает о числе бактерий и об их особенностях. Также новые алгоритмы учитывают популяционные отличия микробиома жителей России.
«Граждане каждой страны отличаются друг от друга наличием тех или иных бактерий и их численностью. До недавнего времени приходилось анализировать микрофлору россиян на основе данных из других стран, так как сведений о микробиоме нашей страны не было, — рассказал Лаврентий Данилов, соавтор разработки. — Мы исправили эту ситуацию».
Теперь ученые планируют получить сертификат соответствия в Министерстве здравоохранения РФ. Если все пройдет успешно, комплексный анализ станет доступен пациентам с ОМС.
Читайте больше актуальных новостей тут.
